Istraživačka postaja na Martinskoj otvorena je 22. prosinca 1980. godine s ciljem proučavanja osnovnih procesa i utjecaja čovjeka na prirodne karakteristike vode, razvoja akvakulture, održivog razvoja akvakulture i turizma te usavršavanja mladih znanstvenika.
Područje Šibenika odabrano je zbog centralne pozicije na hrvatskom dijelu Jadrana, te zbog blizine slatkih, boćatih i slanih voda, čime je područje Šibenika posebno pogodno za razvoj akvakulture, a i znanstvena istraživanja.
Istraživačka postaja na Martinskoj predstavlja, inače, ekstenziju laboratorija Zavoda za istraživanje mora i okoliša te drugih laboratorija Instituta Ruđer Bošković. Misija istraživačke postaje je stvarati znanstvene informacije i obavještavati društvo o novim otkrićima.
